More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1918 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  68.49 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  68.92 
 
 
87 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  64.79 
 
 
85 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  53.09 
 
 
81 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  53.09 
 
 
81 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  53.09 
 
 
81 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.85 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  51.85 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  54.22 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  57.89 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  57.89 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  60.87 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  51.35 
 
 
82 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  49.38 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  55.71 
 
 
206 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  52.7 
 
 
81 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  54.29 
 
 
214 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  61.43 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  51.35 
 
 
81 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  53.01 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  51.76 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  61.43 
 
 
74 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  50.62 
 
 
81 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.25 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  60.87 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  47.56 
 
 
82 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50.63 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  57.53 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  55.41 
 
 
84 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  54.41 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.41 
 
 
86 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0889  protein of unknown function DUF37  74.32 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00411126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  56.06 
 
 
73 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  52.17 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  50.63 
 
 
80 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  52 
 
 
75 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  55.07 
 
 
77 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  54.22 
 
 
83 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.72 
 
 
77 aa  87  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  86.7  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  50.68 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.07 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  52.7 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  55.71 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  53.62 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  52.7 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  54.29 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.72 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  48.68 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.28 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.71 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  50.67 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3156  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
77 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  54.79 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  52.17 
 
 
71 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.93 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
78 aa  84.3  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39780  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.06 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000230088  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 
130 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5948  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
87 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  59.02 
 
 
64 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  52.17 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3643  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00362393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  52.94 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>