More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1854 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  88.83 
 
 		 412 aa  757    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  80.1 
 
 		 412 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  82.77 
 
 		 412 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  74.88 
 
 		 420 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  79.08 
 
 		 414 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  849    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  71.81 
 
 		 416 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 		 415 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  71.78 
 
 		 413 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 		 415 aa  594  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  71.04 
 
 		 415 aa  594  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  69.31 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  69.55 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 411 aa  571  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 419 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 412 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 413 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  65.51 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 413 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 413 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 410 aa  544  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  63.96 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 411 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  63.95 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 410 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  65.59 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.01 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 416 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.36 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 424 aa  531  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  68.1 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.78 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 430 aa  521  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  62.92 
 
 		 422 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 412 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 416 aa  519  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 434 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 418 aa  511  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 439 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>