More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1832 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  352  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  82.39 
 
 
171 aa  274  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  77.85 
 
 
170 aa  265  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.68 
 
 
171 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  63.91 
 
 
171 aa  228  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  63.25 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  61.76 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  63.19 
 
 
166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  65.36 
 
 
167 aa  217  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  62.58 
 
 
166 aa  216  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  66.67 
 
 
166 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  62.58 
 
 
166 aa  215  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  62.58 
 
 
166 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  64.67 
 
 
169 aa  214  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  62.05 
 
 
171 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  63.4 
 
 
166 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  63.4 
 
 
166 aa  207  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  63.4 
 
 
166 aa  207  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  60.78 
 
 
167 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  60.78 
 
 
167 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  55.29 
 
 
173 aa  197  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  50.3 
 
 
171 aa  189  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  53.25 
 
 
232 aa  184  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  53.42 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  56.52 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  56.52 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  55.56 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  48.17 
 
 
166 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  49.38 
 
 
168 aa  168  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  50.31 
 
 
171 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  45.96 
 
 
164 aa  164  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.4 
 
 
228 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  53.16 
 
 
168 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  51.9 
 
 
168 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  47.5 
 
 
164 aa  155  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  43.21 
 
 
204 aa  153  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  42.01 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  42.01 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  45.45 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  48.28 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.3 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.16 
 
 
197 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.16 
 
 
197 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  44.16 
 
 
197 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  44.16 
 
 
197 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.16 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  49.4 
 
 
181 aa  147  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.86 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  46.15 
 
 
167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  46.88 
 
 
168 aa  143  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.17 
 
 
165 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  44.31 
 
 
170 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  49.67 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  44.51 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  44.51 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  43.9 
 
 
168 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  43.29 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  44.38 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  44.51 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  44.51 
 
 
167 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  43.21 
 
 
172 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.91 
 
 
165 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  44.24 
 
 
168 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  45.12 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  43.11 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  45.12 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  43.11 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  44.51 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  43.29 
 
 
167 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  41.98 
 
 
166 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.9 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  42.68 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  43.21 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  42.07 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  40.85 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  41.98 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  43.29 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  40.99 
 
 
165 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  44.17 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  43.9 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  41.46 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  41.92 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.85 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  43.03 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  43.03 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>