75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1828 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  34.38 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  34.71 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 		 297 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  29.78 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  29.22 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  29.92 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.99 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.99 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.99 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  32.87 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  27.16 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  27.16 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  25.97 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.23 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  30.33 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  23.93 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  34.13 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  22.13 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  23.68 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  27.19 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  26.55 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  26.7 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.63 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  24.66 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  27.18 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  25.63 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  25.64 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  24.43 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  28.33 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.68 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  26.84 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  32.49 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  21.4 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  27.01 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  26.16 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  22.55 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  26.78 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  22.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  27.39 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  28.82 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  29.26 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  27.44 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  24.77 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  30.98 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  26.38 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  25.1 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  26.47 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  24.14 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  24.9 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  26.87 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  24.89 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 251 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  28.38 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  33.6 
 
 		 174 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>