More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1814 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
551 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  77.5 
 
 
551 aa  896    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
550 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
551 aa  680    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
551 aa  678    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
551 aa  1121    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
556 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
559 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
554 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
587 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
559 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
589 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
589 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
584 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
592 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
586 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
586 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
598 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
556 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
579 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
579 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
557 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
568 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
556 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
570 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
553 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
588 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
553 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
556 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
553 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
561 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
556 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  44 
 
 
586 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
556 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
556 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
585 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
553 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
611 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  44 
 
 
592 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
556 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  46 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
564 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
560 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
562 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
609 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
598 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
587 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
561 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
546 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
569 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
553 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
546 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
598 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
564 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
561 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
590 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
575 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
586 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
605 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
550 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
583 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
551 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
592 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
597 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
556 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
561 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
598 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
550 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
583 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
587 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
597 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
562 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
550 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
562 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
556 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
542 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
561 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
597 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
550 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
563 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1654  arginyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
549 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0671403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
562 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
556 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
585 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
597 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
556 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>