28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1810 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  57.18 
 
 
782 aa  767    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  51.81 
 
 
816 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  100 
 
 
758 aa  1519    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  34.65 
 
 
722 aa  347  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  30.22 
 
 
736 aa  251  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.39 
 
 
704 aa  230  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  20.95 
 
 
713 aa  104  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  20.82 
 
 
713 aa  103  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  19.92 
 
 
712 aa  99.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  22.07 
 
 
713 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  21.68 
 
 
708 aa  92.8  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  23.11 
 
 
699 aa  92.4  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  31.25 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.5 
 
 
715 aa  71.2  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  20.76 
 
 
699 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  25.49 
 
 
758 aa  57  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  26.2 
 
 
713 aa  57.4  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.38 
 
 
851 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0669  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  25.14 
 
 
851 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0627584  normal  0.110022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  32.94 
 
 
837 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  32.94 
 
 
840 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0154  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  31.58 
 
 
853 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  27.78 
 
 
853 aa  48.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  32.47 
 
 
743 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0438  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  28.22 
 
 
826 aa  47  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  19.46 
 
 
729 aa  47.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1409  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  32.22 
 
 
871 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  32.18 
 
 
712 aa  45.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>