More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1800 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  80 
 
 
202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
199 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  46.24 
 
 
211 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  45.98 
 
 
202 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
198 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  51.22 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  46.33 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  44.1 
 
 
188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  44.25 
 
 
204 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  54.92 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  45.76 
 
 
203 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  56.76 
 
 
438 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  43.68 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  55.93 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  45.51 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
206 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.98 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  56.36 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  59.63 
 
 
261 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  45.25 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 
239 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 
239 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 
239 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.78 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  56.8 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 
209 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  43.26 
 
 
209 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 
318 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  54.05 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  43.26 
 
 
209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.58 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 
299 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
245 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 
251 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 
251 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  49.18 
 
 
233 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 
251 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  55.45 
 
 
146 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  54.55 
 
 
189 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 
207 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.42 
 
 
442 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  41.11 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  58.04 
 
 
194 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  41.36 
 
 
198 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  51.59 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  50.43 
 
 
202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  54.13 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.06 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  43.54 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  48.78 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  46.03 
 
 
174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.99 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  47.54 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  55.26 
 
 
201 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 
327 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.5 
 
 
217 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.96 
 
 
261 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  48.76 
 
 
251 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  50.44 
 
 
197 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.96 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  33.88 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  40.8 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 
362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50.93 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  46.76 
 
 
272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  50.44 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.59 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  58.1 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  56.6 
 
 
206 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  40 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  36.5 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  40 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  40 
 
 
261 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 
224 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.16 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 
158 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  56.19 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  37.22 
 
 
326 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.88 
 
 
297 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>