54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1775 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 		 334 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  85.89 
 
 		 335 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  76.65 
 
 		 334 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  60.46 
 
 		 332 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  64.07 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  58.84 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  57.54 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  59.62 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  53.19 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  51.54 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  52.84 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  51.4 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  48.62 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  49.54 
 
 		 331 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  47.35 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  48.76 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  48.61 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.33 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.94 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  33.46 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  32.71 
 
 		 248 aa  119  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.16 
 
 		 255 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  30.26 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.37 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.38 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  26.24 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  39.25 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.25 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  24.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  28.88 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.43 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  25.66 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.05 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  21.96 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  22.57 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  21.58 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.01 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.01 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.01 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.01 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.01 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.83 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  25.43 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.41 
 
 		 234 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>