More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1757 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
61 aa  119  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  68.33 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  65 
 
 
62 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  60.66 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  56.67 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  55.93 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  52.46 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  52.46 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  50.82 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  50.82 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  50.88 
 
 
62 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  55.93 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  50 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  52.46 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  51.72 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  54.24 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  56.67 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
67 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  49.15 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  49.18 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
65 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>