More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1751 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
126 aa  257  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  86.51 
 
 
126 aa  225  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  83.33 
 
 
126 aa  223  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  80.16 
 
 
126 aa  209  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2051  30S ribosomal protein S8  64 
 
 
127 aa  167  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00264712  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  60.98 
 
 
127 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  56.92 
 
 
132 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  57.81 
 
 
130 aa  148  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  57.25 
 
 
131 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  53.97 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  144  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  57.36 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  56.59 
 
 
131 aa  140  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  53.85 
 
 
132 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  53.85 
 
 
134 aa  141  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  52.67 
 
 
134 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  53.44 
 
 
131 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  50.77 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  50.79 
 
 
131 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
132 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 
131 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  53.12 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 
132 aa  135  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
132 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  52.21 
 
 
136 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
132 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 
132 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  51.13 
 
 
135 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  50 
 
 
131 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  48.44 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  52.31 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  53.44 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  53.17 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 
130 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 
130 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
130 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  52.31 
 
 
132 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  51.16 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  50.78 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  51.91 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  52 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 
133 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 
131 aa  133  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 
132 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  48.44 
 
 
131 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.97 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  47.24 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000574269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  49.22 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  48.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>