More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1750 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  353  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  75.84 
 
 		 178 aa  279  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  73.74 
 
 		 179 aa  278  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  60.11 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 177 aa  201  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  178  4e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.3 
 
 		 180 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  49.41 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  44.13 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>