More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1748 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 163 aa  319  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  89.57 
 
 		 163 aa  293  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  88.96 
 
 		 163 aa  288  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  79.75 
 
 		 163 aa  262  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  76.69 
 
 		 163 aa  257  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  83.95 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  62.96 
 
 		 166 aa  216  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 163 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  65.41 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  210  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 169 aa  210  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  65.61 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  64.74 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  64.56 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  64.78 
 
 		 166 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  63.46 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 165 aa  203  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  62.26 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  65.41 
 
 		 167 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  200  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  64.71 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  59.26 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 162 aa  193  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  60.65 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  59.74 
 
 		 177 aa  188  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 166 aa  187  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 190 aa  184  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  183  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 175 aa  183  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 171 aa  183  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  61.74 
 
 		 173 aa  183  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  59.48 
 
 		 192 aa  183  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  62.16 
 
 		 179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 172 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60 
 
 		 197 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 186 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 199 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  60.26 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 167 aa  177  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  62.09 
 
 		 170 aa  176  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 187 aa  176  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  56.89 
 
 		 189 aa  176  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 169 aa  176  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 210 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  60.26 
 
 		 200 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  56.86 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0773  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.554764  normal  0.012841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  56.86 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 191 aa  174  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 206 aa  174  4e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2307  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  59.33 
 
 		 188 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0511  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.478223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>