246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1747 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 56 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 56 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 56 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 56 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  43.64 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  43.64 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>