More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1654 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  701    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  64.45 
 
 		 345 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  50.43 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  34.83 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.16 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  49.59 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.81 
 
 		 218 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.52 
 
 		 239 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  44.86 
 
 		 623 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.1 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 230 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 230 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  46.28 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  44.14 
 
 		 210 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  44.14 
 
 		 210 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.11 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 1755 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  43.97 
 
 		 575 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42.73 
 
 		 222 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.59 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 215 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  43.12 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  43.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  39.82 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  43.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 230 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  44.86 
 
 		 1987 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 637 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.2 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.12 
 
 		 407 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.61 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.4 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  42.24 
 
 		 572 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.55 
 
 		 402 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 1026 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 319 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 231 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  40.37 
 
 		 270 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 263 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  38.68 
 
 		 631 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.08 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 224 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 533 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 264 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.72 
 
 		 427 aa  86.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 226 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.51 
 
 		 620 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  45.1 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.52 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 195 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  39.62 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  45.24 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.12 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.12 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.86 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.12 
 
 		 641 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  38.74 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  38.74 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.02 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  38.46 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  43 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.86 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.17 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  36.36 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.83 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  36.36 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  38.74 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>