More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1611 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  100 
 
 		 482 aa  971    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  77.48 
 
 		 481 aa  724    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  59.41 
 
 		 475 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  60.37 
 
 		 480 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  58.04 
 
 		 473 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  54.89 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  47.84 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  47.88 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  47.37 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  49.67 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.17 
 
 		 466 aa  358  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.45 
 
 		 464 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  47.92 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  46.06 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  45.12 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  44.49 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  44.84 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.74 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.07 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.68 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.58 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.18 
 
 		 477 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.19 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.18 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.18 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.43 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  40.29 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.24 
 
 		 474 aa  329  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 		 499 aa  329  8e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.12 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.88 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.96 
 
 		 513 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.96 
 
 		 513 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42 
 
 		 474 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  43.43 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.8 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  43.07 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.58 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.82 
 
 		 511 aa  323  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  43.44 
 
 		 490 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  40.72 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  42.62 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.72 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  42.94 
 
 		 499 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  41.39 
 
 		 502 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  42.74 
 
 		 499 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  44.39 
 
 		 473 aa  319  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.3 
 
 		 477 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  42.08 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.98 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.74 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.6 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.95 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.03 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.03 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.94 
 
 		 511 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  44.01 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.37 
 
 		 485 aa  316  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  45.1 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  41.03 
 
 		 494 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  40.76 
 
 		 494 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.73 
 
 		 506 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.94 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  40.6 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  42.39 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  42.39 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  42.39 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  42.77 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  42.77 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  42.77 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.77 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.6 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  38.72 
 
 		 527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.9 
 
 		 502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.8 
 
 		 502 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.7 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.8 
 
 		 502 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.8 
 
 		 485 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  43.05 
 
 		 509 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.27 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.79 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  42.27 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  40.93 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  43.75 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40.41 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.53 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.67 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.12 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.12 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 		 515 aa  309  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.42 
 
 		 503 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  42.67 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.07 
 
 		 535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.98 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.41 
 
 		 520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.08 
 
 		 514 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  38.12 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.26 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>