72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1596 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  330  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  72.67 
 
 
174 aa  247  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  66.47 
 
 
175 aa  227  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  65.32 
 
 
175 aa  220  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  65.12 
 
 
175 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  61.27 
 
 
175 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.14 
 
 
176 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  43.35 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  46.24 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.79 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  47.71 
 
 
185 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.97 
 
 
185 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  51.03 
 
 
192 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  43.36 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 
419 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  32.53 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  40.13 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
647 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.86 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  42.98 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.57 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  32.52 
 
 
373 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  32.78 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  29.84 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  33.91 
 
 
399 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.8 
 
 
138 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.1 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.32 
 
 
330 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.12 
 
 
218 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  34.52 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  35.12 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.13 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  28.23 
 
 
136 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  33.06 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.63 
 
 
140 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.1 
 
 
159 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.67 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  26.36 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  31.09 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.27 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.79 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  26.72 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.45 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.91 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  28 
 
 
137 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
462 aa  47.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.58 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.45 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.45 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.27 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.56 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.96 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.92 
 
 
290 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.06 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.78 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  33.67 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.83 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
354 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.82 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.54 
 
 
139 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.48 
 
 
332 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  33.12 
 
 
385 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.48 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.53 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.93 
 
 
371 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.86 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>