More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1584 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  510  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  38.27 
 
 
250 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  43.27 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
327 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  185  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  33.74 
 
 
250 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  38.93 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  36.93 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  37.96 
 
 
256 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
249 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 
247 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
390 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
390 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  39.75 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
391 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  36.97 
 
 
390 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
392 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
391 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
398 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  37.25 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 
392 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  33.74 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0767  hypothetical protein  44.33 
 
 
128 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0255585  normal  0.0371895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  40.17 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0083  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
382 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  31.21 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.36 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 
424 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.19 
 
 
377 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.84 
 
 
408 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.12 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
363 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.93 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  25.53 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  25.53 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  32.86 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
250 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.33 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
268 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
402 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1926  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.43 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.76 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.28 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  26.09 
 
 
559 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  25.77 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.19 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.69 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.3 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3969  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.95 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00511048  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0988  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.86 
 
 
417 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>