184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1565 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
169 aa  352  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  79.88 
 
 
171 aa  293  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  67.46 
 
 
186 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  5.12633e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  57.14 
 
 
168 aa  215  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  3.23257e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  56.55 
 
 
171 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  58.58 
 
 
172 aa  203  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  56.8 
 
 
177 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  55.95 
 
 
172 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  55.95 
 
 
172 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48628e-10 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  60.87 
 
 
164 aa  197  4e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  4.4787e-12 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  52.69 
 
 
174 aa  193  8e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.56866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  50.3 
 
 
176 aa  193  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  54.04 
 
 
161 aa  189  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  49.7 
 
 
171 aa  184  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.23127e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  51.81 
 
 
171 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  50.6 
 
 
173 aa  181  5e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  49.1 
 
 
173 aa  180  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.53889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  50.6 
 
 
170 aa  180  9e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.20561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  50.6 
 
 
170 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.19081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  55.29 
 
 
175 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  49.4 
 
 
176 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.24545e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  49.69 
 
 
163 aa  173  1e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  54.44 
 
 
171 aa  172  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  45.24 
 
 
170 aa  172  2e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  47.88 
 
 
169 aa  171  6e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  49.07 
 
 
163 aa  170  8e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.3 
 
 
166 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  45.78 
 
 
173 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.65061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  45.96 
 
 
164 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  45.91 
 
 
167 aa  165  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  43.48 
 
 
164 aa  165  3e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  46.3 
 
 
164 aa  163  1e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  47.2 
 
 
162 aa  163  1e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.20076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  43.64 
 
 
168 aa  161  4e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  42.51 
 
 
172 aa  160  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  44.65 
 
 
167 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  45.34 
 
 
165 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  44.17 
 
 
163 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.82999e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  43.71 
 
 
175 aa  155  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  46.39 
 
 
168 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  hitchhiker  1.91654e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  46.11 
 
 
168 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  46.39 
 
 
168 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  46.39 
 
 
168 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  45 
 
 
163 aa  154  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  45.78 
 
 
168 aa  154  5e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  45.78 
 
 
168 aa  154  5e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  45.78 
 
 
168 aa  154  5e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  45.78 
 
 
168 aa  154  5e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  45.78 
 
 
168 aa  154  5e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.63521e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  44.1 
 
 
162 aa  152  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  41.92 
 
 
175 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  46.58 
 
 
165 aa  151  3e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  45.18 
 
 
168 aa  151  3e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.5071e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  41.32 
 
 
175 aa  151  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  44.72 
 
 
162 aa  150  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  43.4 
 
 
175 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  42.42 
 
 
168 aa  146  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.92038e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  44.03 
 
 
175 aa  145  2e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  41.25 
 
 
160 aa  144  4e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.33256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  42.77 
 
 
175 aa  144  8e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  40.96 
 
 
172 aa  143  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  40.12 
 
 
170 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
174 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  46.39 
 
 
164 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  42.14 
 
 
175 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  45.51 
 
 
168 aa  141  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  42.14 
 
 
175 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  43.48 
 
 
164 aa  139  1e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
178 aa  138  5e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
178 aa  138  5e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
178 aa  138  5e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  42.14 
 
 
178 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  42.14 
 
 
178 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  41.51 
 
 
175 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  42.14 
 
 
178 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  42.14 
 
 
178 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1624  ferritin  40.24 
 
 
169 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2341  ferritin family protein  40.24 
 
 
169 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.410916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  40.24 
 
 
169 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  40.88 
 
 
175 aa  137  8e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  42.14 
 
 
178 aa  137  9e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2122  Ferroxidase  38.69 
 
 
168 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  41.51 
 
 
178 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  41.14 
 
 
172 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  40.88 
 
 
175 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  40 
 
 
166 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  38.1 
 
 
168 aa  134  7e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  39.88 
 
 
175 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.52 
 
 
170 aa  131  4e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.39627e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  40.62 
 
 
181 aa  131  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  40.62 
 
 
165 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  40.62 
 
 
165 aa  129  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  4.65713e-11 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2236  Ferroxidase  39.24 
 
 
169 aa  129  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.694695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2486  ferritin  41.88 
 
 
165 aa  128  4e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  37.35 
 
 
172 aa  128  4e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  40 
 
 
165 aa  126  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  38.89 
 
 
165 aa  125  2e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  37.34 
 
 
171 aa  125  2e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  40 
 
 
165 aa  126  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  4.82664e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  40 
 
 
165 aa  126  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>