More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1524 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  63.49 
 
 
550 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  73.94 
 
 
556 aa  798    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  57.69 
 
 
567 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  100 
 
 
559 aa  1134    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  55.11 
 
 
566 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  57.35 
 
 
548 aa  596  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  54.43 
 
 
557 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  51.32 
 
 
561 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  51.14 
 
 
561 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  51.75 
 
 
560 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  49.91 
 
 
561 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  49.74 
 
 
561 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  53.97 
 
 
574 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  54.64 
 
 
558 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  50.52 
 
 
584 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.91 
 
 
556 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1435  NAD+ synthetase  53.31 
 
 
529 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0116683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.47 
 
 
577 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.42 
 
 
566 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  45.5 
 
 
569 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.42 
 
 
566 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.25 
 
 
566 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  45.68 
 
 
569 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  49.05 
 
 
567 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0752  NAD+ synthetase  48.52 
 
 
560 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  46.83 
 
 
576 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  48.04 
 
 
540 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.41 
 
 
577 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  48.92 
 
 
552 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  50.27 
 
 
564 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  47.76 
 
 
558 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  47.15 
 
 
573 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.67 
 
 
561 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  47.94 
 
 
571 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  44.84 
 
 
543 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.92 
 
 
576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  46.32 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  43.36 
 
 
565 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.75 
 
 
576 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  46.17 
 
 
554 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  46.42 
 
 
539 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  43.09 
 
 
565 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  43.36 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  45.91 
 
 
564 aa  462  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  43.06 
 
 
558 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  47.62 
 
 
545 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  45.47 
 
 
562 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  47.43 
 
 
545 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  47.16 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  47.24 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  47.16 
 
 
554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  42.22 
 
 
546 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  45.24 
 
 
538 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.51 
 
 
569 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  49.37 
 
 
543 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.04 
 
 
559 aa  452  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  44.39 
 
 
538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  44.68 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.31 
 
 
565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  44.89 
 
 
565 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  45.13 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  46.05 
 
 
546 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  45.96 
 
 
542 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  47.92 
 
 
569 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  48.3 
 
 
539 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  48.93 
 
 
549 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  43.45 
 
 
540 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  44.48 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  47.98 
 
 
569 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  48.93 
 
 
549 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  42.86 
 
 
583 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  46.76 
 
 
562 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  45.91 
 
 
566 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  38.55 
 
 
573 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  43.45 
 
 
540 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  44.76 
 
 
546 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  41.98 
 
 
554 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  43.45 
 
 
540 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  45.97 
 
 
554 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  43.27 
 
 
540 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  47.47 
 
 
577 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  42.16 
 
 
542 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  42.81 
 
 
587 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  42.16 
 
 
542 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  45.47 
 
 
559 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  41.03 
 
 
545 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  46.28 
 
 
587 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  45.88 
 
 
541 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.95 
 
 
575 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  46.32 
 
 
561 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  45.39 
 
 
585 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  43.69 
 
 
540 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.52 
 
 
535 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  44.76 
 
 
583 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.24 
 
 
537 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  37.58 
 
 
574 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  44.94 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  47.29 
 
 
566 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  46.45 
 
 
568 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  46.61 
 
 
566 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>