More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1519 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  72.87 
 
 		 434 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  85.65 
 
 		 434 aa  789    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  83.99 
 
 		 433 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  67.98 
 
 		 435 aa  648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 435 aa  892    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  69.84 
 
 		 433 aa  662    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  65.59 
 
 		 433 aa  627  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  66.28 
 
 		 435 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  66.36 
 
 		 434 aa  618  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  66.44 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  68.4 
 
 		 435 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  66.36 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  66.13 
 
 		 434 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  65.36 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  65.28 
 
 		 434 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  65.43 
 
 		 435 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  61.48 
 
 		 434 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  61.2 
 
 		 432 aa  571  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  60.97 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  61.06 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  61.2 
 
 		 439 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  61.06 
 
 		 433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  62.18 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  60.8 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  61.03 
 
 		 444 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  59.12 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  59.35 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  64.85 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  59.35 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  60.74 
 
 		 441 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  59.12 
 
 		 446 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  60.33 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  60.14 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  59.12 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  60.42 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  59.53 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  58.43 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  58.78 
 
 		 436 aa  541  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  57.97 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  58 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.61 
 
 		 432 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  56.48 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  61.41 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  60.85 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  60.43 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  61.08 
 
 		 441 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  55.61 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  60.85 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  58.63 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.94 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  56.02 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  55.45 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  54.25 
 
 		 439 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  55.56 
 
 		 433 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  56.05 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  57.55 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  55.32 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 		 432 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  54.35 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  54.44 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  55.06 
 
 		 433 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  52.82 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  57.18 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  55.76 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 436 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  54.72 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  56.02 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  56.6 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  56 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  58.08 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  56.13 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  56.71 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  56.44 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  53.77 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  53.35 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  53.64 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  55.81 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  51.72 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  56.21 
 
 		 437 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  54.67 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  57.98 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  54.8 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  55.53 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  54.69 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  55.04 
 
 		 439 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  54.59 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  55.97 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  56 
 
 		 435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  55.74 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.94 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  55.74 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  54.72 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  54.35 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  55.48 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  56.64 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>