More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1432 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 
321 aa  650  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  75.43 
 
 
290 aa  439  1e-122  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  62.89 
 
 
309 aa  398  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  8.60406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  59.17 
 
 
310 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  57.29 
 
 
292 aa  345  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  57.99 
 
 
306 aa  337  1e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 
296 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  43.1 
 
 
295 aa  266  3e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  47.08 
 
 
297 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  46.05 
 
 
295 aa  262  7e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  43.77 
 
 
295 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  43.77 
 
 
295 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  43.9 
 
 
295 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  43.84 
 
 
296 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  47.44 
 
 
295 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  41.33 
 
 
302 aa  255  8e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  46.69 
 
 
295 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  44.37 
 
 
294 aa  251  8e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  46.21 
 
 
308 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.52 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  42.81 
 
 
296 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  41.36 
 
 
302 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  41.69 
 
 
302 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.89 
 
 
298 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
296 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  43.36 
 
 
297 aa  249  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.39 
 
 
298 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  40.6 
 
 
302 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  44.71 
 
 
301 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.1 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.1 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.99 
 
 
298 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.79 
 
 
299 aa  246  5e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45.52 
 
 
295 aa  244  1e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.99 
 
 
298 aa  244  2e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 
292 aa  244  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  44.98 
 
 
302 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  44.98 
 
 
302 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.3 
 
 
298 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  40.42 
 
 
296 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.94 
 
 
322 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 
316 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 
303 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  44.83 
 
 
296 aa  239  6e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  45.24 
 
 
295 aa  239  6e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.52 
 
 
316 aa  239  6e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  44.98 
 
 
304 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  45.67 
 
 
305 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.94 
 
 
322 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 
292 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  45.17 
 
 
295 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 
306 aa  236  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
333 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  43.73 
 
 
277 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.94 
 
 
318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.94 
 
 
318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.94 
 
 
318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.04 
 
 
333 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 
305 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
329 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
305 aa  235  1e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
333 aa  234  1e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
333 aa  234  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
305 aa  235  1e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.48 
 
 
302 aa  234  1e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  8.94527e-13 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.1 
 
 
305 aa  234  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.92 
 
 
298 aa  234  1e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.27 
 
 
298 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.83 
 
 
315 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
300 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.93 
 
 
294 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 
298 aa  232  7e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 
298 aa  232  7e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 
298 aa  232  7e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 
297 aa  232  8e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  43.79 
 
 
309 aa  231  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 
298 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  44.33 
 
 
302 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  41.24 
 
 
301 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.66 
 
 
305 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.43659e-07  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
311 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  41.58 
 
 
298 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  45.49 
 
 
295 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 
309 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 
304 aa  228  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 
309 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.56 
 
 
322 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
300 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
300 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.86 
 
 
302 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
311 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  39.6 
 
 
300 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  41.58 
 
 
299 aa  226  4e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>