More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1396 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  100 
 
 
334 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  54.17 
 
 
373 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.56 
 
 
330 aa  355  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
329 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  61.46 
 
 
331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  52.12 
 
 
337 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  50.48 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  50 
 
 
323 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  46.93 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  49.84 
 
 
323 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
318 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  45.36 
 
 
311 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.13 
 
 
313 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
478 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
498 aa  233  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  47.16 
 
 
278 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
492 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  45.14 
 
 
319 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
482 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  39.58 
 
 
338 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
485 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
535 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
477 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
494 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
480 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
485 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.8 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.22 
 
 
495 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
481 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
504 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
468 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
481 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
508 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
482 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  39.86 
 
 
518 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
477 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
485 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
506 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  37.58 
 
 
374 aa  202  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
479 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.01 
 
 
546 aa  202  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
472 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
492 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.26 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  45.83 
 
 
314 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
480 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
506 aa  199  5e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
488 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
483 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  44.41 
 
 
316 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
495 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
475 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
469 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
483 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
490 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
881 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
481 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
465 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
465 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
481 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
476 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
490 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
492 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
477 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  43.77 
 
 
316 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
467 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
472 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
501 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.41 
 
 
296 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
486 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
485 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  42.34 
 
 
309 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
491 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
471 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.54 
 
 
310 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
473 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
496 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
464 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
468 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
488 aa  189  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  45.56 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
466 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
466 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.48 
 
 
293 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
477 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
492 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
488 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  42.01 
 
 
297 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05721  glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
306 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.832335 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
499 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  46.46 
 
 
283 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
464 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.06 
 
 
298 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>