More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1388 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  100 
 
 		 323 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  60.63 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  46.47 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  46.96 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  50.95 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 380 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  46.13 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  48.57 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  44.93 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  45.51 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  48.74 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  45.76 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  47.39 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  42.01 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  45.76 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  51.02 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  44.84 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  41.16 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  46.77 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  46.23 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  43 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  44.48 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  48.65 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  40.06 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  43.55 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  46.28 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  38.58 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  40 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  43 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  40.4 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  44.67 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  39.73 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  41.11 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 		 374 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  26.95 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 365 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  26.57 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  30 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  21.24 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  29.83 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  21.24 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.47 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  29.15 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  21.67 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  26.87 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  29.45 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  30.11 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.97 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.2 
 
 		 490 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  28.02 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  29.2 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.43 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  25.19 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.43 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.3 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  26.95 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.18 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.83 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  27.95 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  27.56 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  26.97 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  27.34 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  28.97 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  25.45 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  28.41 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  26.69 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  27.61 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  23.4 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  25.72 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.2 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  27.52 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.79 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  26.15 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.32 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.83 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.66 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.11 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  27.13 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  27.44 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  27.61 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.82 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  26.06 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.58 
 
 		 458 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  27.27 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  27.71 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  27.31 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.32 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  22.18 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  26.17 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  26.67 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  24.06 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.59 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.62 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>