More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1369 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  100 
 
 		 572 aa  1174    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  59.9 
 
 		 580 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  61.5 
 
 		 576 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  65.72 
 
 		 599 aa  778    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  49.91 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  50 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.67 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  39.78 
 
 		 640 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.78 
 
 		 619 aa  273  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.49 
 
 		 593 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.9 
 
 		 599 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.51 
 
 		 611 aa  266  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.41 
 
 		 573 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.27 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.37 
 
 		 601 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  34.43 
 
 		 575 aa  263  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  33.54 
 
 		 574 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  33.7 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.7 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.7 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  32.32 
 
 		 623 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.87 
 
 		 703 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  33.13 
 
 		 574 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  33.13 
 
 		 574 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.7 
 
 		 613 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.92 
 
 		 574 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  33.48 
 
 		 574 aa  259  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.95 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  33.48 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.66 
 
 		 600 aa  257  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.98 
 
 		 660 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  36.46 
 
 		 674 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.98 
 
 		 660 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.24 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.42 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  38.28 
 
 		 588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.64 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.19 
 
 		 584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.56 
 
 		 660 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.07 
 
 		 660 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.04 
 
 		 574 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.93 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  39.44 
 
 		 647 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.84 
 
 		 583 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  33.26 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35.16 
 
 		 564 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.85 
 
 		 651 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.66 
 
 		 655 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.93 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.66 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.73 
 
 		 604 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.38 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.69 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  35.5 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.41 
 
 		 614 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.24 
 
 		 601 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  39.94 
 
 		 592 aa  251  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  36.83 
 
 		 584 aa  250  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.22 
 
 		 660 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.12 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.42 
 
 		 587 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.33 
 
 		 586 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.59 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.13 
 
 		 652 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  33.45 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  38.57 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  35.11 
 
 		 639 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.43 
 
 		 663 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.55 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.65 
 
 		 663 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  33.62 
 
 		 576 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.94 
 
 		 544 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.2 
 
 		 600 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  36.96 
 
 		 647 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.71 
 
 		 582 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 604 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  36.78 
 
 		 655 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  31.74 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.88 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.4 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.78 
 
 		 605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.93 
 
 		 664 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.64 
 
 		 584 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.3 
 
 		 576 aa  244  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>