More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1352 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  100 
 
 
358 aa  727    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  72.65 
 
 
349 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  68.51 
 
 
346 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  54.2 
 
 
348 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  52.63 
 
 
346 aa  358  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  51.33 
 
 
337 aa  333  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.24 
 
 
421 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  40.92 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  39.24 
 
 
370 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  39.83 
 
 
368 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  41.76 
 
 
367 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  41.67 
 
 
433 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  39.2 
 
 
426 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  41.6 
 
 
442 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  41.21 
 
 
435 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  38.95 
 
 
368 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  41.67 
 
 
425 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  38.4 
 
 
375 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.68 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  39.66 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.71 
 
 
412 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  38.95 
 
 
368 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  41.04 
 
 
400 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  42.22 
 
 
395 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  41.62 
 
 
397 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.23 
 
 
384 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  40.82 
 
 
386 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  40.24 
 
 
400 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  39.88 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  40.96 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  40.51 
 
 
383 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.82 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  40.52 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  38.06 
 
 
360 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  40.11 
 
 
394 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  36.26 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  39.36 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  39.89 
 
 
430 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  35.55 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  38.26 
 
 
373 aa  232  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.67 
 
 
356 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  37.43 
 
 
389 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.43 
 
 
377 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  37.54 
 
 
365 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  37.54 
 
 
360 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  36.15 
 
 
379 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  37.54 
 
 
377 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  36.42 
 
 
366 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  34.8 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  40.24 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  36.76 
 
 
365 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  35.07 
 
 
332 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  31.76 
 
 
337 aa  177  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.64 
 
 
330 aa  175  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.05 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  32.61 
 
 
302 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  30.99 
 
 
447 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.09 
 
 
324 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.5 
 
 
308 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.59 
 
 
301 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  30.88 
 
 
447 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  32.3 
 
 
302 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  30.17 
 
 
322 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  32.4 
 
 
302 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.86 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  31.72 
 
 
303 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.13 
 
 
306 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.63 
 
 
307 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  30.72 
 
 
307 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  31.9 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  32.84 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  29.38 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  33.54 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.89 
 
 
326 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.35 
 
 
343 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  32.92 
 
 
343 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  28.99 
 
 
329 aa  143  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.11 
 
 
333 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  31.76 
 
 
304 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  33.54 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.26 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  30.68 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.83 
 
 
338 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.31 
 
 
345 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  29.48 
 
 
332 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  32.62 
 
 
327 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  29.2 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.07 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  33.54 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  29.84 
 
 
351 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  31.96 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  31.17 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  31.3 
 
 
311 aa  139  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  30.59 
 
 
306 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>