116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1343 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  100 
 
 		 103 aa  200  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  69.9 
 
 		 102 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  54.37 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  46.39 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  37.35 
 
 		 97 aa  66.6  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  40.2 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  35.92 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  36.79 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  33 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  33.96 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  33.96 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  33.96 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  42.47 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  34.29 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  28.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  34.95 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 287 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  30.19 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  39.44 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 219 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 219 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  28.57 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  27.84 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  27.96 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  36.62 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  32.22 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  30.48 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  31.07 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  31.07 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  32.95 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  29.87 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  29.03 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  31.17 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  31.51 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  28.18 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  25 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1460  hypothetical protein  34.07 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  30.48 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  29.36 
 
 		 216 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  26.74 
 
 		 207 aa  42  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  31.31 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 104 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  31.51 
 
 		 221 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  27.4 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 237 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  24.21 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 202 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>