More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1311 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  100 
 
 		 440 aa  906    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  65.6 
 
 		 436 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  56.15 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  51.38 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  46.19 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  44.29 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  43.9 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  44.8 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  43.62 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  42.69 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  41.28 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  36.21 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  35.21 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  35.55 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  34.28 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  33.85 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  31.56 
 
 		 457 aa  226  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  32.31 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  32.08 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  32.61 
 
 		 459 aa  206  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  31.55 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  27.7 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.37 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  46.94 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  27.76 
 
 		 306 aa  100  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.94 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  48.45 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  48.94 
 
 		 303 aa  96.3  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  43.93 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.97 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45.61 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  42.2 
 
 		 244 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  33.12 
 
 		 269 aa  93.6  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.35 
 
 		 266 aa  93.6  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  47.06 
 
 		 284 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  42.86 
 
 		 268 aa  93.6  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.28 
 
 		 273 aa  93.2  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  30.14 
 
 		 286 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.9 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  41.41 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  41.28 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  38.24 
 
 		 294 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  40.82 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.39 
 
 		 291 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.42 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.08 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40.78 
 
 		 309 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.12 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  42.24 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.75 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  40.44 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.9 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.84 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.33 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  40.82 
 
 		 274 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.22 
 
 		 305 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.22 
 
 		 305 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  38.78 
 
 		 275 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.96 
 
 		 285 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.22 
 
 		 305 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.41 
 
 		 300 aa  87.4  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  44.9 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  39.8 
 
 		 305 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.49 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  38.78 
 
 		 275 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  38.78 
 
 		 275 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  43.88 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.94 
 
 		 328 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.4 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  35.07 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  42.55 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  44.9 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.59 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  44.44 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.59 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  42 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.96 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  33.33 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.59 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.84 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.59 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  43.88 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  43.43 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  42.16 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  34.38 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.58 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  39.22 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  39.13 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  41.9 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  43.43 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.91 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  40 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  43.88 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.84 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>