More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1208 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  100 
 
 		 167 aa  330  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  50.32 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  45.95 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  40.52 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  41.94 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  43.42 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.1 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  39.87 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  42.86 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  42.07 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  36.48 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  42.07 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  37.91 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  38.36 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  37.09 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  37.82 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  39.86 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.56 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  42.76 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  35.62 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  39.62 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  39.75 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  39.13 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  39.04 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.05 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  36.54 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.23 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.1 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  38.67 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.42 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  38.22 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.62 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.71 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  35.76 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  35.76 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  35.76 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  35.76 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  40.24 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  38.73 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  42.25 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  42.25 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.76 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.76 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  39.47 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.06 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.06 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.55 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  36.31 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.9 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.1 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.33 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.67 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  30.46 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  29.8 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  29.8 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  36.49 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.67 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  38.46 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  32.3 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  35.67 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  29.8 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.3 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.89 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  37.58 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  34.97 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  32.65 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.92 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  35.1 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.28 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.01 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  35.1 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.36 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.94 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.13 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.13 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.22 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.54 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.54 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.64 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  37.5 
 
 		 185 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.1 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  34.19 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  29.14 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  29.14 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  29.14 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.64 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  37.68 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.9 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.65 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>