More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1175 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  100 
 
 
730 aa  1470    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  30.19 
 
 
739 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  30.41 
 
 
729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  28.18 
 
 
749 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  31.42 
 
 
734 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  25.3 
 
 
721 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  25.15 
 
 
721 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  27.42 
 
 
727 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  25.99 
 
 
1053 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  27.07 
 
 
733 aa  179  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  27.92 
 
 
1177 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  25.7 
 
 
963 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  25.88 
 
 
731 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  24.05 
 
 
964 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  24.59 
 
 
619 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  21.23 
 
 
955 aa  117  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0104  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  24.86 
 
 
565 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  22.85 
 
 
552 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  22.28 
 
 
736 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.48 
 
 
606 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  26.77 
 
 
536 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  22.9 
 
 
548 aa  101  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  24.44 
 
 
583 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  22.57 
 
 
570 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.99 
 
 
747 aa  98.2  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  22.43 
 
 
552 aa  97.4  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  25.74 
 
 
575 aa  97.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  22.85 
 
 
563 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  25.27 
 
 
730 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  23.99 
 
 
605 aa  95.1  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  24.48 
 
 
568 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  26.53 
 
 
581 aa  94.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  25.51 
 
 
572 aa  94.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  25.26 
 
 
729 aa  94  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  21.8 
 
 
552 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  24.69 
 
 
541 aa  92.8  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  22.81 
 
 
557 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  22.55 
 
 
568 aa  91.3  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  24.86 
 
 
561 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  22.62 
 
 
556 aa  90.5  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  22.72 
 
 
562 aa  89.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  23.85 
 
 
573 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  21.91 
 
 
573 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  22.32 
 
 
568 aa  88.2  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  22.36 
 
 
568 aa  88.2  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  24.67 
 
 
604 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  24.36 
 
 
594 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0754  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  23.49 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  24.71 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0671  sulfate transporter  23.75 
 
 
510 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.045325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1057  sulphate transporter  23.53 
 
 
574 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0213258  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  25 
 
 
581 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  25.39 
 
 
583 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  20.55 
 
 
570 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  25.85 
 
 
587 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  23.34 
 
 
577 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  21.56 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  21.23 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2050  sulphate transporter  22.22 
 
 
571 aa  82.4  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.135317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  24.78 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  22.92 
 
 
550 aa  82  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  23.47 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2305  sulphate transporter  24.75 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  24.89 
 
 
540 aa  81.6  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  24.14 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  22.5 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  23.73 
 
 
550 aa  81.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  23.73 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  24.77 
 
 
555 aa  80.5  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  23.68 
 
 
565 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  23.66 
 
 
560 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  23.66 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  21.68 
 
 
556 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  22.65 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  21.49 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  21.74 
 
 
580 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  22.05 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  22.48 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  21.77 
 
 
579 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  21.98 
 
 
553 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  25 
 
 
585 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  22.27 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  22.7 
 
 
549 aa  77  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  21.81 
 
 
519 aa  77  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  24.29 
 
 
512 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  23.55 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  22.6 
 
 
574 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  23.71 
 
 
512 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  23.42 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  23.16 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  25.28 
 
 
585 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  23.13 
 
 
567 aa  75.5  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  23.43 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1058  sulphate transporter  22.4 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161168  normal  0.396315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1067  putative sulfate transporter YchM  23.05 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  22.7 
 
 
552 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  22.36 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  22.74 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  23.46 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2505  sulphate transporter  23.09 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>