More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1171 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 648 aa  842    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 640 aa  714    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 670 aa  900    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 663 aa  1372    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 642 aa  1032    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  81.15 
 
 		 657 aa  1093    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 648 aa  846    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 636 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 650 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 642 aa  565  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 632 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 650 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 654 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 629 aa  558  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 634 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 653 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 629 aa  558  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 647 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 653 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 648 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 628 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 655 aa  535  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 628 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 648 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 670 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 634 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 638 aa  515  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 660 aa  515  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 660 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 660 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 660 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 660 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 660 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 660 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 660 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 660 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 660 aa  505  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 665 aa  501  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 659 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 642 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 666 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 624 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 509 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 508 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 675 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 702 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 656 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 644 aa  477  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 667 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 675 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 632 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 651 aa  462  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 512 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 664 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 654 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 516 aa  445  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 628 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0176  methionyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 528 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 628 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  43.08 
 
 		 574 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 538 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3650  methionyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 722 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 525 aa  416  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 533 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>