208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1158 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  46.56 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  45.83 
 
 		 487 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  48.45 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.47 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.74 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.53 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.22 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.22 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.22 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.22 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  30.09 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.45 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  28.76 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.31 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  39.29 
 
 		 350 aa  85.5  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.78 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  27.63 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  37.72 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  36.52 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  37.84 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  38.79 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  35 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  32.21 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  34.25 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  33.61 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  33.61 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  33.61 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  37.39 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  35.09 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  25.94 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.51 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  34.23 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  26.83 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  28.03 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  32.81 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.01 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.27 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  32.82 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  29.58 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  26.34 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  30.09 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  32.74 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  23.66 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  34.68 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  34.51 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.59 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  30.7 
 
 		 488 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  36.21 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  30.17 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  30.7 
 
 		 488 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  33.83 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  26.9 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  24.07 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  37.5 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  34.51 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  25.38 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  23.55 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  28.81 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  36.79 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  32.65 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  33.93 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  29.25 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  33.93 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>