More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1145 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  60.72 
 
 
563 aa  675  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
565 aa  1165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  69.03 
 
 
576 aa  789  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  50.63 
 
 
540 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  52.36 
 
 
538 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  54.65 
 
 
538 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  54.11 
 
 
540 aa  576  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  54.82 
 
 
533 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  50.36 
 
 
546 aa  563  1e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 
539 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  53.91 
 
 
534 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  43.76 
 
 
551 aa  455  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  60.11 
 
 
381 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
498 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 
559 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 
501 aa  331  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
555 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  33.05 
 
 
509 aa  246  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
527 aa  245  2e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
508 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
526 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
619 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
557 aa  234  4e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.14 
 
 
511 aa  229  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.88 
 
 
511 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
618 aa  227  5e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
553 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  28.4 
 
 
579 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  31.22 
 
 
518 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  28.22 
 
 
580 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.86 
 
 
594 aa  222  1e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 
622 aa  222  2e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1568  oligopeptide-binding protein, putative  65.56 
 
 
164 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.467595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 
554 aa  218  3e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.27 
 
 
520 aa  216  1e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
628 aa  213  6e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  31.08 
 
 
593 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.68 
 
 
534 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
600 aa  209  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.97 
 
 
510 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
608 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 
545 aa  206  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.29 
 
 
524 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.88 
 
 
511 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.2 
 
 
534 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 
532 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
528 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.31 
 
 
516 aa  203  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
866 aa  202  2e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
544 aa  200  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
556 aa  199  8e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.8 
 
 
511 aa  198  2e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.45 
 
 
511 aa  199  2e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.87 
 
 
524 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 
521 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
544 aa  196  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.5 
 
 
596 aa  196  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28.71 
 
 
495 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.71 
 
 
509 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.44 
 
 
521 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
521 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 
521 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 
521 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 
584 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
556 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
522 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
512 aa  191  3e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
517 aa  191  3e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.99 
 
 
518 aa  190  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
574 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.06 
 
 
540 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
586 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.22 
 
 
505 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
536 aa  186  1e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 
534 aa  186  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.08 
 
 
542 aa  185  2e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.01 
 
 
556 aa  185  2e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 
573 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 
502 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 
528 aa  184  5e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.5 
 
 
542 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.19 
 
 
510 aa  183  9e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
559 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.72 
 
 
531 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.04 
 
 
520 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.6 
 
 
539 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 
524 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
544 aa  180  6e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
572 aa  180  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.77 
 
 
545 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.76 
 
 
541 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
530 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
595 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.96 
 
 
520 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
534 aa  178  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
535 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
534 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.01 
 
 
529 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
535 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
519 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>