78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1091 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
347 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  79.03 
 
 
361 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  66.57 
 
 
347 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  54.39 
 
 
343 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  47.8 
 
 
343 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  45.48 
 
 
361 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
348 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  35.92 
 
 
375 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 
366 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
388 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 
384 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
386 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
375 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
371 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
377 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  33.87 
 
 
387 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.78 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.37 
 
 
534 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.67 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.67 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
531 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.23 
 
 
314 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
321 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.23 
 
 
314 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
528 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
327 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.67 
 
 
318 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
314 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.23 
 
 
314 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.32 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  31.49 
 
 
322 aa  163  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.59 
 
 
324 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  32.37 
 
 
325 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  33.45 
 
 
316 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 
336 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  32.75 
 
 
313 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
534 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
344 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
344 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
336 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.89 
 
 
376 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  32.32 
 
 
313 aa  150  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.97 
 
 
323 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  29.97 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.8 
 
 
314 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 
333 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
295 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  29.87 
 
 
326 aa  124  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
352 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  28.04 
 
 
326 aa  117  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  26.83 
 
 
313 aa  109  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
309 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
228 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 
228 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
249 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
192 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
187 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
287 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>