More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1086 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1086  serine dehydratase alpha chain  100 
 
 		 502 aa  1017    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.787533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0011  serine dehydratase alpha chain  70.12 
 
 		 459 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  44.97 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000127179  hitchhiker  0.000000403127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2251  serine dehydratase alpha chain  47.37 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.472865  normal  0.778553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  45.13 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  42.63 
 
 		 458 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  43.28 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  40.71 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  44.02 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  43.79 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  43.14 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  42.97 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  42.69 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  41.43 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  43.25 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  42.35 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  42.35 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  42.18 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  41.2 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  40.43 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  42.35 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  41.75 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  42.35 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  40.24 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  44.14 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  41.43 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  41.35 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  43.2 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  43 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  43.25 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  41.35 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  43.81 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  41.35 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  41.75 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  42.91 
 
 		 489 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  40.56 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  41.52 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  44.08 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  44.16 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  40.71 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  40.04 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  43.74 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  42.14 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  43.54 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  41.35 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  41.35 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  41.35 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  41.55 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  41.35 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  41.35 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  42.66 
 
 		 473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  40 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  42.71 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  39.53 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  40.56 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  43.34 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  43.14 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  42.29 
 
 		 462 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  42.2 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  42.29 
 
 		 462 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  43.3 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  41.93 
 
 		 464 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  39.33 
 
 		 458 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  42.08 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  39.84 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  44.02 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  42.4 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  39.33 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  41.72 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  44.05 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  39.64 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  39.33 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  41.35 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  44.02 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  42.74 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  42.77 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  42.89 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  43.28 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  39.69 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  43.28 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  43.74 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  43.03 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  44.64 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2194  L-serine dehydratase 1  44.38 
 
 		 452 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  42.09 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  42.2 
 
 		 458 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  40.04 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  42.38 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  42.83 
 
 		 504 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  42.89 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  39.17 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  39.17 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  42.97 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  41.9 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  39.17 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  39.17 
 
 		 458 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  40.98 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2309  L-serine dehydratase 1  41.77 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>