45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1059 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  50.98 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  42.31 
 
 		 282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  42.5 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  35.2 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  47 
 
 		 172 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  44.95 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  39.66 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  44 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  44.79 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  53.73 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  48.35 
 
 		 167 aa  85.5  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  44.12 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  39.32 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  41 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  37.1 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  35.07 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  28.9 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  38.79 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  36.79 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  36.79 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  36.36 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  47.14 
 
 		 91 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  38.24 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  32.74 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  37.74 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.29 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  34.02 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  35.05 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  32.14 
 
 		 290 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  44 
 
 		 165 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  37.23 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  33.87 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  33.33 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  33.33 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  33.02 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  29.25 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  30.93 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  43.06 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  31.43 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3395  phage-encoded protein  33.09 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000514274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6402  anti-repressor protein  35.87 
 
 		 88 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0869  Phage regulatory protein, Rha-like protein  32.35 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>