More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0991 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  71 
 
 		 498 aa  700    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0991  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 504 aa  1033    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00365365  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  59.43 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.42 
 
 		 460 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0833  Chromosomal replication initiator DnaA  48.87 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.093159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.51 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.02 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  32.71 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  236  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.7 
 
 		 450 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  32.99 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  34.06 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  32.85 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  32.85 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  32.44 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.4 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.06 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.97 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  32.64 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  32.58 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  31.97 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.61 
 
 		 462 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  32.63 
 
 		 450 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  32.09 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  32.09 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.09 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  32.09 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  29.83 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  31.82 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.81 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.64 
 
 		 464 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  31.81 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.26 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  33.55 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  31.74 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  31.76 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.17 
 
 		 460 aa  223  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  32.02 
 
 		 478 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  32.39 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  31.42 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  33.54 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  32.3 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  29.68 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  31.7 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  32.79 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.52 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  27.25 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 		 457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.44 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  32.72 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 		 463 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  28.07 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.48 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  28.24 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  26.86 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  30.61 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  27.59 
 
 		 529 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  29.17 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  28.84 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  28.84 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.53 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.78 
 
 		 511 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  28.86 
 
 		 456 aa  210  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  30.88 
 
 		 512 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  28.78 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  26.87 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.96 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  28.63 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  28.25 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  32.45 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  29.2 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  26.4 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  31.16 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.05 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  29.42 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 466 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  27.39 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  29.81 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  26.91 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  30.47 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  28.09 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>