More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0954 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 478 aa  955    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.4 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.77 
 
 		 831 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.67 
 
 		 684 aa  158  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.65 
 
 		 961 aa  151  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1402 aa  150  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.19 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.97 
 
 		 789 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.21 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1037 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.23 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 1032 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1493 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.82 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.65 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.82 
 
 		 490 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 838 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.99 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.09 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.49 
 
 		 685 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.5 
 
 		 528 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.98 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 1430 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.91 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.71 
 
 		 315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  33.46 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.55 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  33.66 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1002 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.53 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.98 
 
 		 235 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.88 
 
 		 380 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.91 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  35.45 
 
 		 971 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 		 971 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.19 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.44 
 
 		 2413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  33.09 
 
 		 961 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.33 
 
 		 264 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 252 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.82 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 		 448 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.8 
 
 		 865 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.69 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 346 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.8 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.24 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.24 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.84 
 
 		 679 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.4 
 
 		 325 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 976 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  31.09 
 
 		 368 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 254 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.28 
 
 		 380 aa  105  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.04 
 
 		 331 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  28.8 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.04 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 		 278 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  32.54 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.36 
 
 		 839 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.65 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1877 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 293 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 271 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  35.75 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  32.76 
 
 		 346 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.87 
 
 		 523 aa  100  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.74 
 
 		 392 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  24.37 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.97 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.69 
 
 		 680 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.62 
 
 		 331 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.58 
 
 		 890 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.37 
 
 		 305 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.47 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.73 
 
 		 1044 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  31.23 
 
 		 357 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  28.73 
 
 		 1078 aa  97.8  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.93 
 
 		 272 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  27.25 
 
 		 552 aa  96.7  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 387 aa  96.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.76 
 
 		 593 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.75 
 
 		 316 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 		 403 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.18 
 
 		 241 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  32.11 
 
 		 384 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.66 
 
 		 322 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 		 255 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.27 
 
 		 811 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>