221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0948 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  82.26 
 
 
248 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  74.19 
 
 
248 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  71.66 
 
 
248 aa  377  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  71.37 
 
 
249 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  66.53 
 
 
248 aa  342  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  32.37 
 
 
253 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  29.1 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.46 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  29.81 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  27.46 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  29.87 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.37 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25.79 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  27.86 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
207 aa  62  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
209 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  26.54 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
334 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  27.17 
 
 
339 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
297 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
298 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
299 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  28.39 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  23.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  28.57 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  25.13 
 
 
288 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
332 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
324 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  24.36 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  27.63 
 
 
304 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  28 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.24 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  28.29 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  28 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  26.71 
 
 
326 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  29.01 
 
 
351 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25.5 
 
 
321 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
336 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
284 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.22 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.58 
 
 
332 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  26.67 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  29.01 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  25 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  26.14 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  24.39 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>