234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0944 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  61.73 
 
 
274 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  59.8 
 
 
208 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  53.62 
 
 
211 aa  225  5e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  46.6 
 
 
205 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  44.39 
 
 
204 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  41.58 
 
 
207 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  41.29 
 
 
207 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.46 
 
 
204 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  44.69 
 
 
203 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  44.09 
 
 
204 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  43.58 
 
 
203 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  41.41 
 
 
204 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37 
 
 
203 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  44.44 
 
 
210 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  43.68 
 
 
204 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  42.21 
 
 
202 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  40.2 
 
 
204 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  41.94 
 
 
204 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  39.9 
 
 
219 aa  140  1e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  41.4 
 
 
204 aa  141  1e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  43.27 
 
 
204 aa  140  2e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  42.63 
 
 
205 aa  140  2e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  140  2e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  42.63 
 
 
205 aa  140  2e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  42.63 
 
 
205 aa  140  2e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  42.63 
 
 
205 aa  140  2e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  42.63 
 
 
205 aa  140  2e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  41.4 
 
 
204 aa  139  4e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  42.63 
 
 
204 aa  138  8e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  42.63 
 
 
204 aa  138  9e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  138  9e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  42.63 
 
 
204 aa  138  9e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  39 
 
 
204 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  45.68 
 
 
176 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.54 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  43.54 
 
 
204 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  39.04 
 
 
208 aa  134  1e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  35.64 
 
 
204 aa  134  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  42.11 
 
 
204 aa  133  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.03 
 
 
211 aa  132  4e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  37.62 
 
 
211 aa  131  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  36.51 
 
 
204 aa  130  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40.82 
 
 
213 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  43.96 
 
 
209 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  39.71 
 
 
208 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.16 
 
 
206 aa  128  8e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.59 
 
 
198 aa  128  1e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  34.65 
 
 
204 aa  128  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  45.92 
 
 
207 aa  127  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.43 
 
 
213 aa  126  4e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  36.82 
 
 
207 aa  125  8e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  49.59 
 
 
205 aa  125  8e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  41.76 
 
 
239 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.08 
 
 
194 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  39.68 
 
 
290 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
211 aa  121  1e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  44.37 
 
 
208 aa  120  2e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  38.95 
 
 
213 aa  120  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  44.32 
 
 
209 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  38.17 
 
 
213 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  35.29 
 
 
212 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  43.7 
 
 
201 aa  119  4e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
194 aa  117  1e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.89 
 
 
195 aa  117  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.32 
 
 
195 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  117  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.32 
 
 
195 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.32 
 
 
195 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  39.78 
 
 
195 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.76 
 
 
211 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.42 
 
 
245 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  37.37 
 
 
211 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  42.75 
 
 
198 aa  115  4e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.69 
 
 
211 aa  115  7e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48336e-11 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  115  7e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  115  7e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  38.19 
 
 
196 aa  115  8e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.69 
 
 
211 aa  115  8e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  115  9e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  40.86 
 
 
204 aa  115  9e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  115  9e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  38.54 
 
 
196 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 
194 aa  114  1e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  42.42 
 
 
207 aa  114  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.69 
 
 
211 aa  114  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  40.31 
 
 
198 aa  114  2e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  38.14 
 
 
198 aa  114  2e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.69 
 
 
211 aa  113  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  2.66179e-13 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.69 
 
 
211 aa  113  2e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.87 
 
 
201 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.25 
 
 
195 aa  112  4e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>