More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0907 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
415 aa  843  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  66.83 
 
 
430 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  60.53 
 
 
427 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  45.41 
 
 
410 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  43.29 
 
 
411 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
525 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  40.47 
 
 
2401 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 
1268 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 
1435 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 
327 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
1038 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 
1739 aa  136  6e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  38.86 
 
 
700 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
832 aa  131  2e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
1106 aa  130  4e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
717 aa  129  1e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
1077 aa  128  2e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
710 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
703 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
717 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 
1340 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
988 aa  122  2e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
1486 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
683 aa  118  2e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  35.17 
 
 
1644 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  35.17 
 
 
1644 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
785 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
1152 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
294 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
857 aa  114  4e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
1152 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
880 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
360 aa  113  7e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
983 aa  113  7e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
732 aa  112  1e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
1359 aa  111  2e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
1523 aa  111  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
625 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
625 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  32.31 
 
 
1182 aa  109  7e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
602 aa  109  8e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1067 aa  109  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
1509 aa  109  9e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  32.91 
 
 
632 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
1523 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 
733 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
725 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
728 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
994 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
313 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
775 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
1759 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
289 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
632 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
725 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
1162 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
329 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
625 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
652 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.5 
 
 
610 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
313 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
742 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.05 
 
 
1119 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
753 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
691 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
790 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
297 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
586 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
742 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
748 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
670 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
1275 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
691 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
1334 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
273 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
742 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
691 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
684 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
576 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
624 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
721 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 
1561 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
723 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
749 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
746 aa  99.8  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  27.43 
 
 
731 aa  99.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
653 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
307 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
729 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
679 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
311 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
892 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
555 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
662 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
996 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
290 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
274 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
312 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
324 aa  96.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>