122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0879 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1537    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  41.91 
 
 
759 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  60.66 
 
 
482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  41.36 
 
 
760 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  58.82 
 
 
462 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  41.52 
 
 
765 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  41.05 
 
 
755 aa  492  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  55.26 
 
 
472 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  53.12 
 
 
485 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  45.41 
 
 
470 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  48.51 
 
 
450 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  45.63 
 
 
467 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  56.49 
 
 
479 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.58 
 
 
725 aa  300  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  39.41 
 
 
798 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  37.27 
 
 
717 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  36.96 
 
 
717 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  37.05 
 
 
717 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  35.84 
 
 
526 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  35.84 
 
 
526 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.99 
 
 
782 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  34.42 
 
 
695 aa  257  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  34.12 
 
 
524 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  32.04 
 
 
874 aa  249  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  32.04 
 
 
874 aa  249  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.62 
 
 
749 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  34.44 
 
 
843 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  33.57 
 
 
857 aa  233  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  33.41 
 
 
842 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  29.3 
 
 
900 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  30.46 
 
 
882 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  35.2 
 
 
746 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  35.2 
 
 
746 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.77 
 
 
554 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  45.27 
 
 
590 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  31.2 
 
 
788 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  32.95 
 
 
757 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  29.55 
 
 
955 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  32.26 
 
 
612 aa  167  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  26.24 
 
 
770 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.34 
 
 
774 aa  164  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  46.23 
 
 
701 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.56 
 
 
697 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  26.74 
 
 
723 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  31.75 
 
 
613 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  31.03 
 
 
624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.91 
 
 
799 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  43.4 
 
 
732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  33.01 
 
 
756 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  33.7 
 
 
277 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  40.23 
 
 
815 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  39.53 
 
 
437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  31.3 
 
 
868 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  31.3 
 
 
868 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  31.3 
 
 
868 aa  110  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  34.43 
 
 
867 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  27.53 
 
 
540 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.69 
 
 
632 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.24 
 
 
828 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  30.4 
 
 
731 aa  102  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.81 
 
 
769 aa  102  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.29 
 
 
486 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  30.3 
 
 
682 aa  98.2  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.86 
 
 
716 aa  91.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  32.93 
 
 
880 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  29.69 
 
 
720 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  25.97 
 
 
463 aa  89.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  29.24 
 
 
712 aa  88.6  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  30.04 
 
 
712 aa  87.8  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  28.16 
 
 
712 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  28.16 
 
 
712 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  29.51 
 
 
838 aa  86.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.96 
 
 
771 aa  84.3  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  26.71 
 
 
834 aa  80.5  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  21.7 
 
 
1000 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.19 
 
 
531 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  22.47 
 
 
606 aa  72.8  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  45.16 
 
 
102 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  25.39 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  46.67 
 
 
718 aa  67.4  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  25.7 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  28.93 
 
 
1061 aa  66.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  28.06 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  36.44 
 
 
278 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.04 
 
 
776 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.02 
 
 
1039 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  28.22 
 
 
775 aa  62  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  26.49 
 
 
979 aa  61.6  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  23.06 
 
 
636 aa  60.8  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  24.78 
 
 
777 aa  60.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  23.21 
 
 
777 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  27.24 
 
 
1036 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  27.8 
 
 
775 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  28.89 
 
 
624 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  30.85 
 
 
631 aa  58.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  24.21 
 
 
477 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  24.3 
 
 
777 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  24.3 
 
 
777 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  24.3 
 
 
777 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>