More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0840 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
137 aa  266  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  55.04 
 
 
146 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.56 
 
 
139 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  47.01 
 
 
138 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  51.16 
 
 
139 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  51.94 
 
 
152 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.2 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.38 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  48.82 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  48.03 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  46.83 
 
 
139 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.62 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 
144 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  43.41 
 
 
146 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.31 
 
 
143 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  39.67 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  44.36 
 
 
153 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  44.36 
 
 
153 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  43.31 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  37.12 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  43.41 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  42.52 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.54 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  45.16 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  40.62 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  40.62 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  41.88 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.88 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.37 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  38.89 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  39.37 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.5 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  39.37 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.53 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.39 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  42.54 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  45.04 
 
 
157 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  41.27 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  45.04 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  39.26 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  40.46 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40.74 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40.74 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  45.86 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.4 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  37.69 
 
 
139 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
140 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 
137 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  42.97 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  41.32 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  36.76 
 
 
140 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 
144 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.97 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  42.97 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  40.94 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  38.17 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  36.84 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  42.19 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 
149 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.96 
 
 
136 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.96 
 
 
136 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 
149 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  39.2 
 
 
149 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 
149 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 
144 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 
144 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 
154 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  40.3 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.3 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.98 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  41.79 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>