More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0726 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  83.33 
 
 		 144 aa  253  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  77.78 
 
 		 144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  75 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 143 aa  193  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 147 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 149 aa  186  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.72 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  57.34 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 148 aa  183  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 147 aa  183  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 147 aa  183  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 144 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>