175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0704 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  59.38 
 
 
548 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  60.15 
 
 
533 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  85.47 
 
 
539 aa  956    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  60.15 
 
 
533 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  57.43 
 
 
544 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  59.86 
 
 
553 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  59.67 
 
 
547 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  78.25 
 
 
537 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  67.9 
 
 
542 aa  755    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  67.9 
 
 
542 aa  755    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  59.31 
 
 
568 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  68.32 
 
 
542 aa  759    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  60.15 
 
 
533 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  60.71 
 
 
531 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  60.15 
 
 
531 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  100 
 
 
537 aa  1098    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  59.22 
 
 
533 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  59.41 
 
 
541 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  59.67 
 
 
549 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  61.77 
 
 
566 aa  691    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  69.14 
 
 
535 aa  764    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  62.61 
 
 
565 aa  706    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  58.42 
 
 
568 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  58.56 
 
 
550 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  58.58 
 
 
549 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  55.35 
 
 
549 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  58.58 
 
 
549 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  55.13 
 
 
545 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  55.31 
 
 
545 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  55.76 
 
 
549 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  56.23 
 
 
532 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  54.56 
 
 
551 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  55.49 
 
 
549 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  54.74 
 
 
552 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  54.84 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  52.14 
 
 
557 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  51.81 
 
 
552 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  51.54 
 
 
554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  51.17 
 
 
554 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
554 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  51.26 
 
 
554 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  51.36 
 
 
554 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  55.49 
 
 
525 aa  558  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  51.45 
 
 
552 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  51.54 
 
 
557 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  54.58 
 
 
522 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  51.36 
 
 
554 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003799  hydroxylamine reductase  50.72 
 
 
553 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  54.74 
 
 
531 aa  553  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  51.81 
 
 
554 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
554 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  49.55 
 
 
552 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  50.91 
 
 
550 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1035  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0972  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1004  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1390  hydroxylamine reductase  49.55 
 
 
550 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1054  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  50 
 
 
554 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0937  hydroxylamine reductase  50.09 
 
 
550 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4090  hydroxylamine reductase  53.33 
 
 
555 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4555  hydroxylamine reductase  53.33 
 
 
555 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  53.07 
 
 
555 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
557 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  51.01 
 
 
546 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  49.73 
 
 
556 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00878  hydroxylamine reductase  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2769  hybrid cluster protein  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00884  hypothetical protein  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  48.65 
 
 
554 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  48.28 
 
 
554 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0141  hybrid cluster protein  51.72 
 
 
553 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2458  hydroxylamine reductase  49.18 
 
 
550 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  50.18 
 
 
550 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0977  hydroxylamine reductase  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0946  hydroxylamine reductase  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.869117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2723  hydroxylamine reductase  49 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0902  hydroxylamine reductase  48.91 
 
 
550 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.800969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1034  hydroxylamine reductase  49 
 
 
550 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 
554 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  48.01 
 
 
554 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2617  hydroxylamine reductase  48.09 
 
 
550 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4621  hydroxylamine reductase  51.35 
 
 
559 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0716541 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1591  hydroxylamine reductase  48.09 
 
 
550 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2701  hydroxylamine reductase  48.09 
 
 
550 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1973  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 
550 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1666  hydroxylamine reductase  48.55 
 
 
565 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.372025  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6194  hydroxylamine reductase  51.18 
 
 
553 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  normal  0.0395415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  51.17 
 
 
552 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1707  hydroxylamine reductase  49.27 
 
 
550 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01080  hydroxylamine reductase  54.03 
 
 
520 aa  513  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.626709  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  47.45 
 
 
549 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  48.38 
 
 
555 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  45.81 
 
 
555 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0137  hydroxylamine reductase  60.34 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000271526  normal  0.86078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  46.84 
 
 
547 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  46.65 
 
 
547 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  46.25 
 
 
543 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  45.82 
 
 
547 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0214  hydroxylamine reductase  52.49 
 
 
531 aa  488  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.997496 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>