48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0658 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  65.3 
 
 		 536 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1053    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  44.91 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  39.95 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  37.68 
 
 		 395 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  37.2 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  38.39 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  39 
 
 		 415 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  39.23 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  34.95 
 
 		 410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.03 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  32.66 
 
 		 532 aa  266  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.92 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  35.29 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  35.19 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  31.64 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  32.9 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 322 aa  240  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  37.54 
 
 		 321 aa  232  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.42 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  23.29 
 
 		 434 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  32.79 
 
 		 140 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  24.03 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  29.23 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  24.71 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  21.78 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.45 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.68 
 
 		 1079 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  39.71 
 
 		 258 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 621 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 615 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  25.23 
 
 		 311 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3190  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3387  hypothetical protein  32.81 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3309  hypothetical protein  34.38 
 
 		 178 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  25.89 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  30 
 
 		 148 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  24.21 
 
 		 457 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  25.6 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>