38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0637 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  66.47 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  34.25 
 
 		 347 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 326 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  31.98 
 
 		 322 aa  95.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  32.56 
 
 		 332 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  33.57 
 
 		 337 aa  90.5  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  30.51 
 
 		 308 aa  89.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  25.9 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 312 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  33.71 
 
 		 314 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  30.06 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  30.5 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  30.32 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  30.61 
 
 		 317 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  30.3 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 310 aa  70.9  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  29.75 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  23.89 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  21.86 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  23.4 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 368 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  23.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  23.89 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1400 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  22.6 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  21.99 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  23.6 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  28.85 
 
 		 666 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  25.93 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  28.85 
 
 		 1400 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1400 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1400 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  28.85 
 
 		 1400 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0996  peptidase C39 bacteriocin processing  21.5 
 
 		 122 aa  42  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  25.58 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>