105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0630 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  837    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  52.49 
 
 
476 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  44.92 
 
 
376 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  42.68 
 
 
439 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  32.59 
 
 
339 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  32.22 
 
 
346 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  32.41 
 
 
345 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  32.15 
 
 
348 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  33.65 
 
 
348 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  31.36 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  35.79 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  32.83 
 
 
318 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.89 
 
 
318 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  31.96 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  31.96 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.72 
 
 
336 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  32.19 
 
 
337 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  31.67 
 
 
327 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  30.58 
 
 
320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  32.85 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  32.57 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  30.69 
 
 
341 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  28.94 
 
 
338 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.31 
 
 
347 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.48 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.8 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  33.8 
 
 
372 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.32 
 
 
347 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  33.96 
 
 
334 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.6 
 
 
543 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  29.14 
 
 
316 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  29.52 
 
 
352 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  99.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.2 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.36 
 
 
546 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  32.19 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  30.11 
 
 
300 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.62 
 
 
382 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  29.04 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.6 
 
 
607 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.78 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  28.62 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  31.12 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.36 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  25.33 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  31.88 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  27.2 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.08 
 
 
601 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.14 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.36 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.51 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  26.51 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  30.85 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.11 
 
 
568 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  24.92 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.9 
 
 
570 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  25.46 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.91 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  24.3 
 
 
572 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  26.15 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  24.66 
 
 
533 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.79 
 
 
571 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  25.89 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.08 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  29.34 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.57 
 
 
498 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.04 
 
 
332 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  30.08 
 
 
498 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  22.65 
 
 
567 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  28.02 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.1 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  28.78 
 
 
278 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  27.44 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
567 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.48 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.14 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.76 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
868 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.33 
 
 
505 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  23.2 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  22.32 
 
 
433 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  21.97 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
146 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  36.52 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  28.77 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.66 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.66 
 
 
866 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  27.7 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  27.72 
 
 
373 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  21.8 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  35.35 
 
 
968 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  29.17 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  34.78 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  32.67 
 
 
389 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  30.65 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.74 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  28.47 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>