18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0611 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  64.29 
 
 
102 aa  137  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  55.56 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  55 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  54.67 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  56 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  46.74 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  54.67 
 
 
81 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  56.52 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  45.45 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  37.8 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  38.96 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  41.67 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2401  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  37.1 
 
 
795 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0986621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0267  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  37.31 
 
 
1153 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.249441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>