21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0523 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  47.49 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  49.59 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  40.08 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2831  hypothetical protein  26.26 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000373636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  25.37 
 
 		 329 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  27.44 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  37.5 
 
 		 514 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  27.59 
 
 		 785 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  26.54 
 
 		 790 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  37.18 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  26.54 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 656 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  29.63 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  31.85 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1027  cytochrome c class III  34.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  31.85 
 
 		 447 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  22.58 
 
 		 479 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  34.52 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.87 
 
 		 331 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  33.33 
 
 		 557 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>