More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0508 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 648 aa  1295    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  52.95 
 
 		 625 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 640 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  33.68 
 
 		 624 aa  273  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  29.77 
 
 		 614 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  31.57 
 
 		 615 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 308 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.92 
 
 		 327 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.71 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.01 
 
 		 404 aa  127  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.48 
 
 		 323 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 332 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  28.57 
 
 		 349 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  33.67 
 
 		 345 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.8 
 
 		 323 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 		 323 aa  123  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.19 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.19 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.19 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.19 
 
 		 307 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  27.36 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.85 
 
 		 305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 320 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  26.67 
 
 		 341 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  28.19 
 
 		 307 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.19 
 
 		 318 aa  120  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.85 
 
 		 307 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  27.41 
 
 		 344 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  30.03 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  27.51 
 
 		 310 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  28.19 
 
 		 307 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  31.76 
 
 		 318 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.12 
 
 		 323 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.12 
 
 		 323 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  29.6 
 
 		 342 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 349 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  25 
 
 		 308 aa  115  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  27.99 
 
 		 384 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  30.21 
 
 		 346 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.71 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  30.54 
 
 		 350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.25 
 
 		 347 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  29.12 
 
 		 366 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  28.04 
 
 		 394 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.4 
 
 		 343 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  33.1 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  29.3 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  29.91 
 
 		 346 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.39 
 
 		 316 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  28.43 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.42 
 
 		 380 aa  111  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 		 320 aa  111  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6702  putative cobalamin synthesis protein cobW  31.02 
 
 		 309 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203286  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.39 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 330 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.07 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.07 
 
 		 319 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  34.86 
 
 		 407 aa  110  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  26.93 
 
 		 357 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  33.78 
 
 		 410 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.75 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  38.8 
 
 		 350 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.8 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  36.63 
 
 		 362 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  28.43 
 
 		 319 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  29.85 
 
 		 347 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  30.75 
 
 		 324 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.08 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  33.78 
 
 		 404 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 401 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  28.78 
 
 		 373 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 		 346 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 		 353 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  31.37 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  35.37 
 
 		 362 aa  108  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  29.73 
 
 		 340 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  31.56 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  30.11 
 
 		 354 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  31.4 
 
 		 339 aa  107  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 328 aa  107  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 		 403 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.56 
 
 		 345 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 328 aa  107  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.12 
 
 		 316 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  26.63 
 
 		 339 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.22 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  34.92 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>